在事件后，教员主动登门拜访余云岫，想知道他为什么会在大会上提出废除中医的主张？
余云岫解释说，他的真实目的是要引发全社会对中医改革的重视。
如果不采用这么激烈的方式提出问题，就很难推动中医的深刻变革。
然后他更是拿出了自己赶时间写好的改革方案。
里面提出，以后要在中医院校开设解剖学、生理学等现代医学基础课程，同时保留中医经典课程。
随后教员提出最后一个问题，如何看待支持他废除中医的贺、王这两位被免职的副部长。
余云岫说，这两人出发点是好的，但是方法过于激进，认为医学改革应该采取渐进方式，不应该采取完全否定的态度。
这些发言和他在大会上说的完全不一样，但是教员并没有在意这个，因为余云岫的言论在西医中很有市场，本着团结中西医的方针，谈话后不久，卫生部大会再次召开，余云岫被聘为研究院顾问，参与研究制定中医改革计划。
随后，他一直推行中西医结合的改革方针。
一直到六年后，余云岫在沪上逝世。
后世对他正面评价是具有爱国思想和报国之志，在中西医学上都有较深造诣，其医学改良思想和倡导医学革命的精神具有一定积极意义。
负面评价则是他一生主张废除中医，表现出强烈的西化思想，其思想和行为剥离国情，落入了民族虚无主义全盘西化的怪圈。
京城四大名医施今墨之子施小墨，评价他做的废止中医行为：
“是一场建立在无知基础上的闹剧，只有无知的人才会把中医药在华夏几千年文明史上的辉煌一笔抹杀。”
后世《环球人物》则是评价：虽然《废止中医案》最终被取消，但对中医的打击是巨大的。
余云岫对中医基本理论的否定，差不多为当时的舆论界所接受。
从这个意义上讲，余云岫还是达到了一定的目的。
正因如此，20世纪30年代后的一个时期，轻视、歧视、排斥、限制、打击中医的政策和言论不断出现。
而等到二十一世纪，中医们都发现中西医结合有问题的时候，这时候才知道余云岫在三次废除中医失败后的后手，已经在他去世前就埋下了。
这位近代第一中医黑，实至名归。
只是这次，从未来回来了个方言。
余云岫埋下去的手段，随着《中药炮制学》问世，已
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