刘裕回到建康，暗潮浮动的京城立时变得安稳下来。
正月，刘裕马不停蹄地前往京口检阅新军，然后前往彭城、寿春等地视察；然后前往三吴之地鼓励农耕，至船场查看舰只营造，从门阀手中要到一批战舰；接连六十余天都奔波于路上。
三月九日，刘裕回到建康，准备再率兵马前往江陵与杨安玄交战，不料积劳成疾，卧病不起。
此次刘裕病得不轻，吕太医诊脉之后面露难色，萧太后问疾之后，让刘裕召长沙王刘道怜、录尚书事司空徐羡之、新任尚书左仆射傅亮、领军将军谢晦、护军将军檀道济等人入宫，照顾医药。
谢晦向天子刘裕建议向神灵祈祷，刘裕拒绝，仅让侍中谢方明到祖庙焚香祭告；病情稍微减轻，刘裕便在病榻之上处理朝政。
三月十七日，刘裕出现在东堂，接受群臣朝贺，大赦天下。
三月十九日，徐州别驾、宁朔将军刘式之急报，刁逵之子刁弥聚数百众作乱，焚毁停泊在京口水寨中的船舰八十余艘，往广陵方向逃窜。
当年刘裕灭刁家，刁弥恰巧在外，躲过一劫，躲在江淮之地不敢露面。刘裕与杨安玄争雄，处于下风，回转京城后染疾的消息传出，人心浮动、流言四起。
刁弥得到消息，认为刘裕命不久矣，正好趁此时报灭门之仇，于是网罗了百余名部曲潜至京口。
本打算学当年刘裕京口起义那般先夺取刺史府，砍下刘道怜的人头，然后关闭城门以奉天子司马德文旨意讨伐刘裕征召兵马，能战则战，不能战则从海路逃往北青州，到了洛阳总能得个一官半爵。
设想得很完美，真到了京口发现徐州刺史府戒备森严，自己所率的百余人估计连府门都杀不进去。
而且刘裕病重，召徐州刺史刘道怜入宫侍疾，京口由别驾刘式之理政，京口南还有万余招募的新兵，贸然发动恐怕是肉包子打狗。
刁弥见无机可乘，准备乘船过江，见宋军水寨纷乱不堪，船舰出入无序，于是趁夜放火，不想点着了半边天。
刘裕怒不可遏，好不容易从三吴之地征得二百艘战舰，还未出征便损近半，真是大触霉头。
刘式之是刘穆之次子，看在刘穆之的情面上刘裕没有严惩刘式之，只是下诏严斥，命其与驻守广陵的司州刺史范元之合力抓捕刁弥。
刁弥不过是疥癣之疾，刘裕本没有太放在心上，以为三五日便能剿灭，哪料刁弥流窜于江河之上，召聚亡命之徒，抢掠商贾劫取财物，半月之间居
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